眼睛霉菌感染的治疗一般需要根据病情的严重程度决定，病情较轻的患者可通过药物进行治疗，病情较重的患者可进行手术治疗。眼睛霉菌感染属于眼睛的真菌感染，出现这种情况，患者需要及时进行治疗，避免对身体健康产生影响。

1、病情较轻：如果患者出现霉菌感染，病情不是很严重，出现了轻度的红肿、怕光流泪、视力下降等不适症状，此时可以在医生指导下使用抗菌药物治疗，如那他霉素滴眼液、氟康唑滴眼液等，有助于病情的缓解，也可以遵医嘱静脉注射抗菌药物，如氟康唑氯化钠注射液等；

2、病情较重：如果患者的病情比较严重，角膜出现混浊斑、溃疡，有穿孔的风险，此时患者需要进行手术治疗，一般可以进行角膜移植手术、角膜清创手术，可以缓解病情，改善视力。

患者在治疗期间需要注意眼部的卫生，不要用脏手接触眼睛，也不要接触污水，以免使感染情况加重。同时患者需要多注意休息，养成良好的生活习惯，不可以吃刺激性食物，如辣椒、大蒜等，避免吸烟、喝酒，以免加重对眼部的刺激，不利于病情恢复。