中华人民共和国国务院称，当时只有六岁的男童更登确吉尼玛只是普通小孩，为了避免其陷入政治斗争中，政府并于1995年5月17日将其从家中带走“保护起来”（1996年中国政府称）。据星岛环球网，对于尼玛的下落，中国政府向人权组织与西藏流亡分子严格保密。西藏流亡政府称他是“世界上年纪最小的政治犯”，又呼吁国际社会关注；2006年中华人民共和国中央政府则称他状况良好，家人只想过平静生活。[12]

在西藏流亡政府所在地的达兰萨拉，僧人们会特地在4月25日更登确吉尼玛生日当天在佛寺里替其举行平安法会，西藏流亡政府也将这天定为官方纪念日。[3]

西藏自治区副主席尼玛次仁在2007年7月28日曾强调，将更登确吉尼玛称为班禅是“不合法”的，同时强调更登确吉尼玛目前已在西藏上高中，兄弟姐妹中既有学生亦有已工作的社会人士。中华人民共和国政府称其主持金瓶掣签仪式确定十一世班禅后，一直“注意保护其他候选灵童的隐私”，但“一些外国势力不断传播有关谣言”。称更登确吉尼玛是“爱国的公民”，这名“灵童”本身就是一个“受害者”，目前“像普通人民一样生活，不希望外界打扰”。政府“无权干涉其生活，并尊重其意愿”[19]。

2013年，藏人行政中央和西藏人民议会发布联合声明表示，5月17日是第十一世班禅更登确吉尼玛被“秘密劫持”之日，因而将2013年5月17日定为“国际声援西藏日”，以纪念因中华人民共和国政府“侵占西藏所导致非正常死亡的100多万藏人”与2009年后“为争取自由”而自焚的藏人。[20]

2018年4月，第十四世达赖喇嘛声明从“信源”得知更登确吉尼玛仍健康生活，并接受正常的教育。另外，达赖喇嘛还提到一个僧侣拥有多个转世化身在藏传佛教内并非没有先例。然而达赖喇嘛本人和西藏流亡政府从未正式宣布承认获中方承认之竞逐者确吉杰布的班禅地位。[15]

2020年5月19日，中华人民共和国外交部发言人赵立坚在记者会上称，当年的男童（更登确吉尼玛）接受了免费义务教育，已经大学毕业，现在三十一岁，有一份工作，无论是他还是其家庭都不愿被打扰目前正常的生活。[21]